Analizuj, wizualizuj i modeluj dane biologiczne oraz systemy

Biolodzy używają produktów firmy MathWorks do analizy danych i modelowania matematycznego, co pozwala na lepsze zrozumienie i przewidywanie zachowań biologicznych. Mathworks dostarcza jednolitego, zintegrowanego środowiska wspierającego farmakokinetykę (PK), bioinformatykę, biologię systemów, przetwarzanie obrazów biologicznych i biostatystykę.

Możesz użyć produktów MathWorks przeznaczonych dla biologii obliczeniowej w nastepujących zastosowaniach:

• importowanie, analiza, modelowanie danych i prezentacja wyników;
• automatyzacja pracy;
• dostosowywanie algorytmów i narzędzi krytycznych w tworzeniu innowacyjnych metod;
• wykorzystanie sprawdzonych, komercyjnie wspieranych algorytmów i narzędzi.

Analiza danych w biologii obliczeniowej

Poprzez zapewnienie zintegrowanego środowiska dla biologii obliczeniowej, produkty firmy MathWorks eliminują konieczność pracy z wieloma oddzielnymi, niekompatybilnymi narzędziami przeznaczonymi do importu, analizy i udostępniania wyników.

Możliwe jest:

• pobieranie danych z wielu źródeł – baz danych, plików w różnych formatach, bezpośrednio z aparatury;
• udostępnianie wyników poprzez automatycznie generowane raporty HTML i wizualizację danych;
• zrównoleglenie obliczeń redukujące czas ich wykonania;
• automatyzacja analizy w procesach wsadowych i ciągłych;
• wykonanie szeregu analiz, w tym: nieliniowych modeli efektów mieszanych, sekwencji genetycznych, mikromacierzy, drzewa filogenetycznego, spektrometrii masowej i ontologii genów.

Modelowanie matematyczne w biologii obliczeniowej

Produkty MathWorks dostarczają jednolitego środowiska wspierającego wiele różnych typów modeli, takich jak modele farmakokinetyczne (PK) i modele biologii systemów. Zintegrowane środowisko umożliwia tworzenie i analizę modeli, dzięki którym można przewidywać i badać charakterystykę systemu biologicznego.

Graficzne i skryptowe narzędzia modelowania w SimBiology pozwalają na:

• analizę i wizualizację danych zewnętrznych, identyfikację modelu PK (z użyciem PK Wizard) i dopasowywanie modelu do danych;
• implementację sieci reakcji w celu badania dynamiki systemu;
• łączenie modeli takich jak PK z sieciami biochemicznymi;
• udostępnianie wyników poprzez automatycznie generowane raporty.